<Directory /> : c'est la racine du système [de fichiers] pas celle du serveur web ou je ne sais quoi (à moins d'un chroot). Elle permet surtout et notamment de définir une politique (normalement restrictive) par défaut (cf doc).
Et, non, inutile de répéter le bloc à condition de le déplacer dans le serveur "principal" (hors de tout bloc <VirtualHost>).
Et, non, inutile de répéter le bloc à condition de le déplacer dans le serveur "principal" (hors de tout bloc <VirtualHost>).